La Fondation Arp a été créée par Marguerite Hagenbach (deuxième épouse du sculpteur Jean Arp). Elle est reconnue d’utilité publique en 1979 et labellisée « Musée de France » le 9 mars 2004.

La maison-atelier datant de 1927 a été construite selon les plans de Sophie Taeuber (première épouse de Jean Arp), pour abriter leurs œuvres.